53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4208 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  749    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  63.44 
 
 		 381 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  41.4 
 
 		 380 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  45.82 
 
 		 380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  41.11 
 
 		 395 aa  260  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  41.38 
 
 		 395 aa  258  8e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  42.43 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  40.85 
 
 		 395 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  42.43 
 
 		 384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  41.11 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  42.63 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  41.89 
 
 		 384 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  39.74 
 
 		 378 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  39.1 
 
 		 378 aa  249  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  41.33 
 
 		 384 aa  249  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  39.73 
 
 		 400 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  40.32 
 
 		 378 aa  238  9e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  38.48 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  38.46 
 
 		 387 aa  229  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  35.66 
 
 		 411 aa  189  8e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  35.82 
 
 		 375 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  34.86 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  35.46 
 
 		 376 aa  186  8e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  35.47 
 
 		 358 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  38.08 
 
 		 374 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  37.89 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  33.16 
 
 		 372 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  31.17 
 
 		 364 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  30.57 
 
 		 368 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  32.13 
 
 		 384 aa  166  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  32.64 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  29.59 
 
 		 423 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  33.42 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  32.39 
 
 		 373 aa  140  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  26.2 
 
 		 423 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  32.64 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  30.75 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  31.96 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  28.1 
 
 		 389 aa  113  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  28.88 
 
 		 349 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  27.18 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  28.46 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  32.49 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  29.65 
 
 		 379 aa  99.8  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  28.4 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  28.93 
 
 		 378 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  26.33 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4992  hypothetical protein  24.73 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  27.24 
 
 		 573 aa  62.8  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.328812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1233  hypothetical protein  25.49 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.460296  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2036  hypothetical protein  23.35 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997579  normal  0.0998645 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5069  hypothetical protein  29.63 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.511393  normal  0.074715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2702  hypothetical protein  28.46 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.523267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>