52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0417 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  100 
 
 
389 aa  785    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  59.89 
 
 
379 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  40.11 
 
 
378 aa  268  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  29.49 
 
 
349 aa  132  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  28.93 
 
 
371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  28.68 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  27.29 
 
 
375 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  30.54 
 
 
381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  29.7 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  26.49 
 
 
358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  27.88 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  27.27 
 
 
376 aa  110  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  30.17 
 
 
411 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  26.37 
 
 
366 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  29.47 
 
 
395 aa  102  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  26.51 
 
 
384 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  28.07 
 
 
378 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  27.46 
 
 
400 aa  99.8  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  28.94 
 
 
380 aa  99.8  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  30.65 
 
 
395 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  24.4 
 
 
423 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  28.43 
 
 
378 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  26.12 
 
 
364 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  29.07 
 
 
378 aa  96.7  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  29.47 
 
 
395 aa  96.7  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  29.29 
 
 
384 aa  96.3  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  29.8 
 
 
384 aa  96.3  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  28.75 
 
 
358 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  26.11 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  29.65 
 
 
387 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  29.04 
 
 
384 aa  94  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  29.22 
 
 
395 aa  94  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  29.55 
 
 
384 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  24.27 
 
 
374 aa  89.4  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  26.7 
 
 
394 aa  87  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  27.89 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  23.13 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  27.01 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  25.21 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  26.14 
 
 
377 aa  77  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  25.13 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  23.83 
 
 
372 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  24.01 
 
 
372 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  27.76 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1233  hypothetical protein  21.38 
 
 
401 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.460296  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  25.3 
 
 
573 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.328812 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  25.86 
 
 
388 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  30.25 
 
 
355 aa  47.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  24.92 
 
 
363 aa  47  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2036  hypothetical protein  26.96 
 
 
404 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997579  normal  0.0998645 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4992  hypothetical protein  24.77 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5069  hypothetical protein  28.75 
 
 
390 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.511393  normal  0.074715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>