52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0413 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  719    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  45.43 
 
 		 363 aa  296  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  38.32 
 
 		 374 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  39.35 
 
 		 366 aa  236  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  39.05 
 
 		 375 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  38.24 
 
 		 384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  35.73 
 
 		 376 aa  204  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  35.71 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  32.78 
 
 		 423 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  35.19 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  34.52 
 
 		 364 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  33.8 
 
 		 423 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  34.86 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  34.33 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  33.7 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  34.5 
 
 		 388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  32.43 
 
 		 372 aa  162  9e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  34.87 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  33.24 
 
 		 372 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  30.08 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  30.08 
 
 		 378 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  31.96 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  32.71 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  35.35 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  31.49 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  32.47 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  33.22 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  31.32 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  31.32 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  32.47 
 
 		 395 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  31.95 
 
 		 395 aa  119  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  30.61 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  30.89 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  31.95 
 
 		 395 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  30.91 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  30.63 
 
 		 384 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  26.65 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  27.86 
 
 		 378 aa  110  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  28.53 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  28.54 
 
 		 411 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  25.74 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  26.99 
 
 		 394 aa  98.6  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  28.13 
 
 		 370 aa  89.4  8e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  29.7 
 
 		 573 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.328812 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  24.86 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  26.02 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  25.47 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  25.17 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5069  hypothetical protein  24.05 
 
 		 390 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.511393  normal  0.074715 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4992  hypothetical protein  35.71 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1233  hypothetical protein  34.91 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.460296  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1661  hypothetical protein  27.05 
 
 		 346 aa  42.7  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.498777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>