51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3117 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  761    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  46.52 
 
 
381 aa  309  5.9999999999999995e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  44.09 
 
 
371 aa  294  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  39.79 
 
 
378 aa  271  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  40.47 
 
 
395 aa  261  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  39.69 
 
 
395 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  39.95 
 
 
395 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  39.69 
 
 
395 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  40.58 
 
 
378 aa  261  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  40.58 
 
 
384 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  40.58 
 
 
384 aa  258  9e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  40.53 
 
 
387 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  40.32 
 
 
384 aa  255  8e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  39.16 
 
 
384 aa  255  9e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  39.58 
 
 
378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  39.11 
 
 
380 aa  246  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  39.79 
 
 
387 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  38.68 
 
 
394 aa  229  9e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  35.53 
 
 
400 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  33.92 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  34.01 
 
 
376 aa  197  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  31.97 
 
 
372 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  31.62 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  35.75 
 
 
374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  32.23 
 
 
372 aa  182  7e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  38.79 
 
 
366 aa  176  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  31.81 
 
 
423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  32.83 
 
 
380 aa  168  1e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  33.12 
 
 
364 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  32.7 
 
 
411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  34.19 
 
 
384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  31.33 
 
 
358 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  29.56 
 
 
423 aa  149  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  32.14 
 
 
385 aa  145  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  33.54 
 
 
370 aa  143  6e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  30.46 
 
 
374 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  33.22 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  27.37 
 
 
373 aa  117  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  26.65 
 
 
377 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  29.31 
 
 
399 aa  110  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  27.76 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  25.85 
 
 
389 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  26.26 
 
 
388 aa  94  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  30.8 
 
 
363 aa  87.8  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  26.61 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  28.96 
 
 
355 aa  84  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  26.86 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4992  hypothetical protein  31.58 
 
 
395 aa  59.7  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  37.04 
 
 
573 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.328812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2036  hypothetical protein  27.48 
 
 
404 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997579  normal  0.0998645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2702  hypothetical protein  27.83 
 
 
390 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.523267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>