47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2703 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  797    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  63.48 
 
 		 395 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  63.98 
 
 		 395 aa  503  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  62.97 
 
 		 395 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  63.54 
 
 		 384 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  62.97 
 
 		 395 aa  501  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  63.54 
 
 		 384 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  63.02 
 
 		 384 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  63.05 
 
 		 387 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  63.28 
 
 		 384 aa  490  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  62.93 
 
 		 378 aa  487  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  64.27 
 
 		 378 aa  483  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  62.57 
 
 		 387 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  62.13 
 
 		 378 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  57.61 
 
 		 394 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  41.4 
 
 		 381 aa  277  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  39.52 
 
 		 371 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  35.68 
 
 		 380 aa  219  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  35.71 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  36.2 
 
 		 370 aa  169  8e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  33.97 
 
 		 411 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  33.95 
 
 		 375 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  29.69 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  29.29 
 
 		 372 aa  146  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  30.27 
 
 		 423 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  29.89 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  30.6 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  31.12 
 
 		 364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  29.05 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  28.35 
 
 		 380 aa  138  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  30.96 
 
 		 374 aa  135  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  28.43 
 
 		 384 aa  133  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  29.01 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  29.49 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  27.99 
 
 		 423 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  28.12 
 
 		 385 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  26.8 
 
 		 374 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  28.53 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  28.75 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  31.07 
 
 		 355 aa  100  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  28.86 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  25.65 
 
 		 363 aa  87.8  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  27.91 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  26.65 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  24.02 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  25.89 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  22.95 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>