45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1707 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  751    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  40.11 
 
 		 389 aa  247  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  38.98 
 
 		 379 aa  235  8e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  28.8 
 
 		 381 aa  109  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  28.93 
 
 		 371 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  24.28 
 
 		 349 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  27.78 
 
 		 364 aa  86.3  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  25.6 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  28.86 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  29.47 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  25 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  24.86 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  27.03 
 
 		 384 aa  79.7  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  27.15 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  27.03 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  26.86 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  26.63 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  25.87 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  26.59 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  27.39 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  24.32 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  26.42 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  26.17 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  24.46 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  25.75 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  23.76 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  30.64 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  30.81 
 
 		 395 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  25.08 
 
 		 370 aa  62  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  28.46 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  31.18 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  28.38 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  29.07 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  31.95 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  29.24 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  21.78 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  29.07 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  28.65 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  29.24 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  22.04 
 
 		 423 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  22.81 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  22.28 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  19.65 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2036  hypothetical protein  31.25 
 
 		 404 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997579  normal  0.0998645 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  30.95 
 
 		 573 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.328812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>