30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2036 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2036  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  806    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997579  normal  0.0998645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1233  hypothetical protein  43.95 
 
 
401 aa  315  7e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.460296  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5069  hypothetical protein  38.54 
 
 
390 aa  254  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.511393  normal  0.074715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2702  hypothetical protein  39.74 
 
 
390 aa  248  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.523267 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4992  hypothetical protein  33.99 
 
 
395 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  37.62 
 
 
573 aa  69.3  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.328812 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  35.65 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  34.62 
 
 
399 aa  63.2  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  36.46 
 
 
423 aa  60.5  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  23.42 
 
 
380 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  41.18 
 
 
372 aa  57.4  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  23.35 
 
 
371 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  33.33 
 
 
375 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  38.82 
 
 
372 aa  53.5  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  25.47 
 
 
385 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  25.2 
 
 
381 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  34.31 
 
 
355 aa  51.2  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  31.37 
 
 
368 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  31.58 
 
 
364 aa  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  32 
 
 
423 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  34.38 
 
 
358 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  31.25 
 
 
378 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  29.81 
 
 
374 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  29.67 
 
 
374 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  30.23 
 
 
384 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  32.99 
 
 
363 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  31.4 
 
 
366 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  27.48 
 
 
380 aa  43.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  27.97 
 
 
380 aa  43.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  30.23 
 
 
376 aa  43.1  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>