53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1534 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  750    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  39.95 
 
 
368 aa  273  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  40.96 
 
 
380 aa  268  1e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  42.09 
 
 
385 aa  256  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  40.92 
 
 
358 aa  253  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  38.61 
 
 
384 aa  249  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  39.24 
 
 
364 aa  242  9e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  42.27 
 
 
375 aa  232  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  39.24 
 
 
366 aa  229  8e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  40.05 
 
 
376 aa  213  5.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  33.65 
 
 
423 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  31.99 
 
 
423 aa  210  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  35.73 
 
 
372 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  36.2 
 
 
381 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  38.84 
 
 
380 aa  203  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  36 
 
 
372 aa  199  7e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  38.96 
 
 
371 aa  196  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  35.44 
 
 
378 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  33.33 
 
 
358 aa  184  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  36.22 
 
 
374 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  36.26 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  35.19 
 
 
384 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  35.19 
 
 
384 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  35.62 
 
 
395 aa  170  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  35.03 
 
 
395 aa  169  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  34.94 
 
 
384 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  34.77 
 
 
395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  34.42 
 
 
387 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  32.82 
 
 
378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  34.51 
 
 
395 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  34.68 
 
 
384 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  30.63 
 
 
380 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  30.96 
 
 
400 aa  149  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  32.99 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  31.22 
 
 
377 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  31.99 
 
 
387 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  33.51 
 
 
363 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  32.38 
 
 
388 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  34.58 
 
 
373 aa  138  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  39.17 
 
 
355 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  32.97 
 
 
399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  34.46 
 
 
411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  28.26 
 
 
370 aa  103  6e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  31.41 
 
 
573 aa  89.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.328812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  29.07 
 
 
349 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  27.16 
 
 
389 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  26.6 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  23.83 
 
 
378 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5069  hypothetical protein  25.75 
 
 
390 aa  63.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.511393  normal  0.074715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1233  hypothetical protein  26.75 
 
 
401 aa  56.6  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.460296  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4992  hypothetical protein  43.48 
 
 
395 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2702  hypothetical protein  33.7 
 
 
390 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.523267 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2036  hypothetical protein  28.71 
 
 
404 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997579  normal  0.0998645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>