53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5410 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  100 
 
 		 385 aa  769    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  60.89 
 
 		 384 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  55.85 
 
 		 380 aa  409  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  55.41 
 
 		 358 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  43.94 
 
 		 423 aa  333  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  42.76 
 
 		 423 aa  318  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  44.72 
 
 		 366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  43.48 
 
 		 364 aa  269  7e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  41.94 
 
 		 368 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  41.95 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  42.09 
 
 		 374 aa  236  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  40.48 
 
 		 372 aa  235  8e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  40.63 
 
 		 376 aa  232  7.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  40.75 
 
 		 372 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  34.86 
 
 		 358 aa  195  9e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  34.81 
 
 		 381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  37.89 
 
 		 371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  35.81 
 
 		 355 aa  180  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  37.17 
 
 		 363 aa  179  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  33.85 
 
 		 374 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  30.03 
 
 		 380 aa  156  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  31.68 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  32.26 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  32.14 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  30.79 
 
 		 395 aa  152  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  30.51 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  31.39 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  30.86 
 
 		 395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  30.45 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  30.05 
 
 		 378 aa  146  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  30 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  31.36 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  29.56 
 
 		 384 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  30.79 
 
 		 377 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  31.3 
 
 		 378 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  29.74 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  34.75 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  29.93 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  29.24 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  29.5 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  27.85 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  28.04 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  34.35 
 
 		 573 aa  94  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.328812 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  30.37 
 
 		 373 aa  93.2  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  27.63 
 
 		 379 aa  89.7  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  27.02 
 
 		 370 aa  87.4  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  27.8 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  26.9 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4992  hypothetical protein  23.2 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2036  hypothetical protein  25.78 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997579  normal  0.0998645 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5069  hypothetical protein  39.6 
 
 		 390 aa  57  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.511393  normal  0.074715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1233  hypothetical protein  37.62 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.460296  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2702  hypothetical protein  39.36 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.523267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>