53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0949 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  100 
 
 		 573 aa  1095    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.328812 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  45.93 
 
 		 399 aa  249  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  41.73 
 
 		 377 aa  206  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  31.2 
 
 		 358 aa  105  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  32.56 
 
 		 368 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  31.76 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  34.46 
 
 		 385 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  32.29 
 
 		 358 aa  97.1  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  31.37 
 
 		 364 aa  96.7  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  29.5 
 
 		 376 aa  94.4  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  27.75 
 
 		 366 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  28.39 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  31.41 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  27.25 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  25.46 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  27.8 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  32.3 
 
 		 355 aa  81.3  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  27.66 
 
 		 423 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  28.57 
 
 		 374 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  31.8 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  25.93 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  26.46 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  29.67 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  27.18 
 
 		 395 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2036  hypothetical protein  37.62 
 
 		 404 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997579  normal  0.0998645 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  26.17 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  26.49 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  27.24 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  26.38 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  26.49 
 
 		 384 aa  67  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  27.37 
 
 		 381 aa  67  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  26.49 
 
 		 384 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  28.21 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  26.54 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  28.35 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  26.18 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  25.32 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1233  hypothetical protein  31.73 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.460296  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  25.45 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  24.34 
 
 		 394 aa  60.1  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  27.14 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4992  hypothetical protein  32 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  26.07 
 
 		 349 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  24.92 
 
 		 380 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  30.75 
 
 		 370 aa  54.3  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2702  hypothetical protein  33.68 
 
 		 390 aa  53.9  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.523267 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  24.85 
 
 		 378 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  24.66 
 
 		 379 aa  51.2  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  23.15 
 
 		 400 aa  50.4  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5069  hypothetical protein  28.71 
 
 		 390 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.511393  normal  0.074715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  28.01 
 
 		 389 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  25.06 
 
 		 387 aa  47.4  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1661  hypothetical protein  40.43 
 
 		 346 aa  45.8  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.498777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>