52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04319 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  765    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  47.58 
 
 
374 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  37.89 
 
 
375 aa  202  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  34.38 
 
 
376 aa  188  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  33.69 
 
 
366 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  34.85 
 
 
358 aa  179  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  36.27 
 
 
363 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  33.16 
 
 
384 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  30.45 
 
 
380 aa  166  9e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  31.09 
 
 
385 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  31.16 
 
 
423 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  34.15 
 
 
358 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  34.41 
 
 
381 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  34.7 
 
 
372 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  34.6 
 
 
372 aa  143  6e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  27.59 
 
 
368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  27.99 
 
 
423 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  29.63 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  33.25 
 
 
355 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  33 
 
 
377 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  32.65 
 
 
374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  30.8 
 
 
411 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  30.09 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  29.63 
 
 
378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  30.92 
 
 
395 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  29.76 
 
 
384 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  29.51 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  29.73 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  26.77 
 
 
380 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  29.3 
 
 
387 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  29.54 
 
 
384 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  29.14 
 
 
378 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  26.92 
 
 
380 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  33.04 
 
 
387 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  28.75 
 
 
400 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  30.05 
 
 
395 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  31.36 
 
 
395 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  31.07 
 
 
395 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  28.54 
 
 
384 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  30.75 
 
 
394 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  32.59 
 
 
399 aa  93.6  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  28.54 
 
 
370 aa  90.9  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  31.98 
 
 
573 aa  70.9  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.328812 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  26.18 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  24.45 
 
 
389 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  25.46 
 
 
378 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2702  hypothetical protein  36 
 
 
390 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.523267 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4992  hypothetical protein  34.69 
 
 
395 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5069  hypothetical protein  32.67 
 
 
390 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.511393  normal  0.074715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  24.07 
 
 
349 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1233  hypothetical protein  37.88 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.460296  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1661  hypothetical protein  33.09 
 
 
346 aa  43.9  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.498777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>