48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1118 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  768    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  72.35 
 
 		 378 aa  541  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  70.8 
 
 		 395 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  72.75 
 
 		 395 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  70.8 
 
 		 395 aa  534  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  72.56 
 
 		 384 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  72.56 
 
 		 384 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  72.22 
 
 		 395 aa  532  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  72.25 
 
 		 387 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  71.77 
 
 		 384 aa  528  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  71.84 
 
 		 384 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  73.14 
 
 		 378 aa  525  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  71.2 
 
 		 378 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  67.8 
 
 		 394 aa  497  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  62.57 
 
 		 400 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  41.32 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  38.46 
 
 		 371 aa  242  7.999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  39.95 
 
 		 380 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  35.86 
 
 		 380 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  36.62 
 
 		 411 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  33.42 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  34.44 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  31.54 
 
 		 364 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  32.14 
 
 		 366 aa  145  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  28.61 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  29.44 
 
 		 380 aa  142  7e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  32.13 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  30.21 
 
 		 358 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  28.84 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  35.15 
 
 		 374 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  29.11 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  30.46 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  29.24 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  33.52 
 
 		 370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  31.17 
 
 		 358 aa  129  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  31.2 
 
 		 374 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  28.3 
 
 		 423 aa  126  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  31.82 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  31.4 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  33.04 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  28.42 
 
 		 355 aa  88.6  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  27.18 
 
 		 349 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  26.38 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  25.93 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  26 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  28.22 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  22.28 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  24.02 
 
 		 573 aa  51.2  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.328812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>