50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0516 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  740    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  37.01 
 
 
378 aa  182  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  36.2 
 
 
400 aa  176  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  36.46 
 
 
378 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  35.77 
 
 
384 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  35.7 
 
 
395 aa  162  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  35.86 
 
 
387 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  35.62 
 
 
384 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  36.39 
 
 
378 aa  160  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  35.62 
 
 
384 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  31.75 
 
 
380 aa  159  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  35.88 
 
 
395 aa  159  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  35.17 
 
 
395 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  35.36 
 
 
384 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  35.17 
 
 
395 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  32.43 
 
 
380 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  31.78 
 
 
371 aa  149  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  34.7 
 
 
394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  33.6 
 
 
387 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  31.47 
 
 
381 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  30.29 
 
 
411 aa  119  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  28.62 
 
 
366 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  30.13 
 
 
373 aa  99.8  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  27.78 
 
 
375 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  28.38 
 
 
358 aa  93.6  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  25.16 
 
 
364 aa  89.4  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  28.09 
 
 
368 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  26.91 
 
 
372 aa  84  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  28.22 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  24 
 
 
376 aa  82  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  25.39 
 
 
380 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  24.05 
 
 
384 aa  79.7  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  25.87 
 
 
349 aa  79.7  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  27.95 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  24.66 
 
 
358 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  28.83 
 
 
377 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  28.17 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  25.91 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  23.98 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  25.38 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  25.2 
 
 
379 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  25.13 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  24.56 
 
 
374 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  27.93 
 
 
355 aa  63.2  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  25.95 
 
 
399 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  29.77 
 
 
423 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  25.37 
 
 
363 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1233  hypothetical protein  26.32 
 
 
401 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.460296  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  28.74 
 
 
382 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4992  hypothetical protein  30.36 
 
 
395 aa  43.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>