53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4143 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  771    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  65.51 
 
 
380 aa  512  1e-144  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  60.41 
 
 
385 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  56.3 
 
 
358 aa  411  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  44.99 
 
 
423 aa  350  3e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  44.18 
 
 
423 aa  339  5e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  42.97 
 
 
366 aa  288  9e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  43.39 
 
 
364 aa  273  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  41.21 
 
 
376 aa  253  4.0000000000000004e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  40.21 
 
 
368 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  39.11 
 
 
375 aa  249  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  38.24 
 
 
358 aa  242  7.999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  39.84 
 
 
372 aa  237  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  39.95 
 
 
372 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  38.5 
 
 
374 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  34.17 
 
 
381 aa  199  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  36.48 
 
 
363 aa  189  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  33.33 
 
 
374 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  32.13 
 
 
371 aa  172  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  30.87 
 
 
380 aa  169  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  36.71 
 
 
380 aa  166  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  34.21 
 
 
355 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  30.48 
 
 
399 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  31.23 
 
 
378 aa  157  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  31.65 
 
 
377 aa  157  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  33.25 
 
 
388 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  32.33 
 
 
378 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  32.15 
 
 
411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  32.73 
 
 
378 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  30.65 
 
 
395 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  29.8 
 
 
395 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  28.78 
 
 
384 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  28.96 
 
 
395 aa  138  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  29.72 
 
 
395 aa  137  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  28.86 
 
 
384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  29.17 
 
 
387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  28.93 
 
 
384 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  28.72 
 
 
384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  28.32 
 
 
400 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  30.2 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  30.05 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  29.03 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  26.09 
 
 
389 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  27.03 
 
 
378 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  24.8 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  29.39 
 
 
573 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.328812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  25.66 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  25.62 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4992  hypothetical protein  22.8 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1233  hypothetical protein  32.38 
 
 
401 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.460296  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5069  hypothetical protein  36.17 
 
 
390 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.511393  normal  0.074715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2036  hypothetical protein  31.25 
 
 
404 aa  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997579  normal  0.0998645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2702  hypothetical protein  31.63 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.523267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>