48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1147 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  84.56 
 
 
395 aa  648    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  98.7 
 
 
384 aa  748    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  97.92 
 
 
384 aa  727    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  757    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  92.71 
 
 
384 aa  687    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  96.9 
 
 
387 aa  719    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  87.21 
 
 
395 aa  657    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  87.73 
 
 
395 aa  663    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  87.99 
 
 
395 aa  662    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  75.27 
 
 
378 aa  565  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  71.54 
 
 
378 aa  529  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  70.31 
 
 
378 aa  525  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  72.56 
 
 
387 aa  518  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  68.02 
 
 
394 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  63.54 
 
 
400 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  45.1 
 
 
381 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  42.43 
 
 
371 aa  266  5.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  40.72 
 
 
380 aa  254  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  37.6 
 
 
380 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  35.73 
 
 
411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  32.21 
 
 
368 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  32.55 
 
 
364 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  33.33 
 
 
375 aa  159  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  31.03 
 
 
372 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  36.8 
 
 
374 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  29.01 
 
 
380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  35.33 
 
 
370 aa  147  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  31.55 
 
 
366 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  33.74 
 
 
376 aa  143  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  30 
 
 
385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  31.28 
 
 
372 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  31.66 
 
 
358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  30.91 
 
 
423 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  28.43 
 
 
384 aa  136  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  31.32 
 
 
358 aa  130  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  30.93 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  29.74 
 
 
374 aa  125  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  32.62 
 
 
423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  27.18 
 
 
349 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  31.8 
 
 
363 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  29.48 
 
 
388 aa  99.8  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  29.32 
 
 
355 aa  97.4  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  26.24 
 
 
399 aa  90.5  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  35.12 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  27.57 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  28.07 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  23.92 
 
 
378 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  25.06 
 
 
573 aa  60.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.328812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>