48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4173 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  704    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  29.35 
 
 		 381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  29.49 
 
 		 389 aa  116  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  28.88 
 
 		 371 aa  112  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  27.37 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  28.19 
 
 		 368 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  26.77 
 
 		 384 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  26.77 
 
 		 384 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  26.18 
 
 		 395 aa  96.7  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  26.96 
 
 		 379 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  26.77 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  27.35 
 
 		 378 aa  94.4  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  25.92 
 
 		 395 aa  93.2  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  25.92 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  26.17 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  24.28 
 
 		 378 aa  90.5  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  25.96 
 
 		 387 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  27.66 
 
 		 378 aa  88.6  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  25.71 
 
 		 395 aa  87.8  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  25.4 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  25.98 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  27.85 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  26.32 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  26.56 
 
 		 375 aa  79.3  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  28.34 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  28.43 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  26.09 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  26.08 
 
 		 378 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  27.16 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  28.53 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  26.53 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  25.44 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  27.8 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  25.47 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  28.33 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  27.07 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  29.21 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  25.31 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  27.65 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  25.25 
 
 		 399 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  24.46 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  25.38 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  31.58 
 
 		 411 aa  53.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  28.38 
 
 		 423 aa  52.8  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  28.1 
 
 		 375 aa  50.4  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5069  hypothetical protein  26.36 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.511393  normal  0.074715 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  26.07 
 
 		 573 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.328812 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  26.09 
 
 		 363 aa  43.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>