48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1181 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  84.56 
 
 
395 aa  649    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  96.88 
 
 
384 aa  718    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  764    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  97.92 
 
 
384 aa  727    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  92.45 
 
 
384 aa  689    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  98.45 
 
 
387 aa  734    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  87.21 
 
 
395 aa  659    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  87.73 
 
 
395 aa  663    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  87.99 
 
 
395 aa  663    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  75.54 
 
 
378 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  71.54 
 
 
378 aa  528  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  69.79 
 
 
378 aa  520  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  72.56 
 
 
387 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  67.48 
 
 
394 aa  490  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  63.02 
 
 
400 aa  483  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  44.85 
 
 
381 aa  293  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  41.89 
 
 
371 aa  262  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  40.44 
 
 
380 aa  250  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  36.46 
 
 
380 aa  210  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  36.28 
 
 
411 aa  166  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  33.84 
 
 
375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  32.55 
 
 
364 aa  162  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  31.69 
 
 
368 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  31.28 
 
 
372 aa  159  9e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  31.55 
 
 
366 aa  150  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  36.2 
 
 
374 aa  149  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  30.51 
 
 
385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  29.01 
 
 
380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  35.33 
 
 
370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  33.54 
 
 
376 aa  147  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  31.54 
 
 
372 aa  142  7e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  31.4 
 
 
358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  28.43 
 
 
384 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  37.62 
 
 
423 aa  136  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  30.39 
 
 
373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  30.61 
 
 
358 aa  126  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  29.49 
 
 
374 aa  126  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  31.76 
 
 
423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  31.69 
 
 
363 aa  103  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  29.48 
 
 
388 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  26.56 
 
 
349 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  29.32 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  26.35 
 
 
399 aa  90.5  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  34.52 
 
 
389 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  27.32 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  27.13 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  23.45 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  24.81 
 
 
573 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.328812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>