48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1314 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  757    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  79.1 
 
 		 378 aa  596  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  75.54 
 
 		 384 aa  557  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  75.27 
 
 		 384 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  74.73 
 
 		 384 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  74.93 
 
 		 387 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  73.67 
 
 		 395 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  73.14 
 
 		 395 aa  553  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  72.87 
 
 		 395 aa  551  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  72.22 
 
 		 395 aa  546  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  72.14 
 
 		 384 aa  546  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  72.35 
 
 		 387 aa  523  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  69.05 
 
 		 378 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  66.05 
 
 		 394 aa  495  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  62.93 
 
 		 400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  42.52 
 
 		 381 aa  276  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  39.89 
 
 		 380 aa  262  6.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  39.74 
 
 		 371 aa  257  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  36.29 
 
 		 380 aa  226  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  32.12 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  32.57 
 
 		 380 aa  176  9e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  35.95 
 
 		 411 aa  176  9e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  34.43 
 
 		 366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  31.55 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  36.96 
 
 		 370 aa  159  6e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  31.94 
 
 		 364 aa  159  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  36.05 
 
 		 374 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  30.79 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  31.06 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  31.04 
 
 		 376 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  31 
 
 		 423 aa  150  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  28.09 
 
 		 372 aa  149  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  28.54 
 
 		 423 aa  145  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  27.46 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  30.67 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  30.08 
 
 		 358 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  31.25 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  27.14 
 
 		 374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  32.51 
 
 		 363 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  30.23 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  29.04 
 
 		 388 aa  99.4  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  27.78 
 
 		 399 aa  97.1  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  27.66 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  28.07 
 
 		 389 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  26.5 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  24.46 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  25.07 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  23.98 
 
 		 573 aa  53.5  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.328812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>