48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3504 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  781    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  83.8 
 
 		 384 aa  643    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  84.56 
 
 		 384 aa  649    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  84.56 
 
 		 384 aa  648    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  87.8 
 
 		 384 aa  637    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  84.17 
 
 		 387 aa  644    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  90.13 
 
 		 395 aa  696    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  90.38 
 
 		 395 aa  699    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  90.63 
 
 		 395 aa  700    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  72.22 
 
 		 378 aa  552  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  70.86 
 
 		 378 aa  521  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  70.8 
 
 		 387 aa  519  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  70.98 
 
 		 378 aa  519  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  67.28 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  63.98 
 
 		 400 aa  490  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  44.68 
 
 		 381 aa  293  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  41.11 
 
 		 371 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  40.33 
 
 		 380 aa  254  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  37.11 
 
 		 380 aa  206  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  37.05 
 
 		 411 aa  170  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  32.4 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  33.92 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 364 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  30.13 
 
 		 372 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  32.56 
 
 		 366 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  30.79 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  29.19 
 
 		 380 aa  149  7e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  33.23 
 
 		 376 aa  144  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  35.88 
 
 		 370 aa  144  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  29.73 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  34.71 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  30.05 
 
 		 358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  28.61 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  30.38 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  31.2 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  32.11 
 
 		 358 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  29.22 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  31.37 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  32.56 
 
 		 355 aa  106  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  32.42 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  30.63 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  27.08 
 
 		 399 aa  93.6  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  26.3 
 
 		 349 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  35.29 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  27.88 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  25.2 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  27.41 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  25.98 
 
 		 573 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.328812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>