49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3039 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  726    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  45.43 
 
 		 358 aa  305  1.0000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  41.44 
 
 		 374 aa  242  7e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  37.2 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  35.66 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  36.48 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  34.99 
 
 		 380 aa  181  1e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  35.79 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  37.66 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  35.23 
 
 		 358 aa  172  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  33.24 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  35.47 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  29.26 
 
 		 423 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  32.44 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  31.12 
 
 		 423 aa  145  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  32.98 
 
 		 372 aa  145  9e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  31.94 
 
 		 372 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  34.32 
 
 		 355 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  33.23 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  32.51 
 
 		 378 aa  117  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  31.76 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  28.83 
 
 		 371 aa  109  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  31.4 
 
 		 387 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  30.56 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  30.87 
 
 		 395 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  29.16 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  32.12 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  30.56 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  32.42 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  28.4 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  31.8 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  32.01 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  31.69 
 
 		 384 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  28.5 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  31.8 
 
 		 384 aa  99.4  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  32.12 
 
 		 384 aa  99.4  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  28.32 
 
 		 394 aa  96.3  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  30.41 
 
 		 399 aa  95.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  27.66 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  25.65 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  29.4 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  28.34 
 
 		 573 aa  63.9  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.328812 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  26.23 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  26.67 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  23.59 
 
 		 349 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4992  hypothetical protein  32.99 
 
 		 395 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  23.14 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2036  hypothetical protein  32.99 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997579  normal  0.0998645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2702  hypothetical protein  32.61 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.523267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>