53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1463 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  761    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  47.58 
 
 		 388 aa  300  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  41.88 
 
 		 375 aa  258  8e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  38.32 
 
 		 358 aa  258  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  41.44 
 
 		 363 aa  239  5e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  38.95 
 
 		 376 aa  238  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  36.6 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  36.18 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  33.6 
 
 		 372 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  31.41 
 
 		 380 aa  186  4e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  34.92 
 
 		 423 aa  185  9e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  33.33 
 
 		 384 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  33.6 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  38.3 
 
 		 358 aa  180  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  35.54 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  33.33 
 
 		 385 aa  162  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  32.46 
 
 		 355 aa  160  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  36.68 
 
 		 374 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  28.46 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  28.57 
 
 		 368 aa  145  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  30.75 
 
 		 371 aa  142  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  31.66 
 
 		 377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  30.46 
 
 		 380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  28.77 
 
 		 411 aa  125  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  29.74 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  27.14 
 
 		 378 aa  121  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  29.23 
 
 		 384 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  29.74 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  31.49 
 
 		 387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  28.17 
 
 		 384 aa  119  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  29.23 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  31.14 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  28.86 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  26.58 
 
 		 378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  31.19 
 
 		 395 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  29.01 
 
 		 387 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  26.25 
 
 		 400 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  31.36 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  27.46 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  30.56 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  25.93 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  30.21 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  22.93 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  23.76 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  25.44 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  26.34 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  25.38 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5069  hypothetical protein  24.73 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.511393  normal  0.074715 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  38.89 
 
 		 573 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.328812 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1661  hypothetical protein  30.71 
 
 		 346 aa  53.5  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.498777  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2036  hypothetical protein  29.81 
 
 		 404 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997579  normal  0.0998645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1233  hypothetical protein  31.37 
 
 		 401 aa  46.6  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.460296  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4992  hypothetical protein  29.52 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>