31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1233 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1233  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  795    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.460296  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2036  hypothetical protein  43.95 
 
 		 404 aa  312  6.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997579  normal  0.0998645 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5069  hypothetical protein  43.8 
 
 		 390 aa  293  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.511393  normal  0.074715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2702  hypothetical protein  42.42 
 
 		 390 aa  272  6e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.523267 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4992  hypothetical protein  33.33 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  23.43 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  37.62 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  31.73 
 
 		 573 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.328812 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  39.36 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  35.24 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  34.65 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  34.65 
 
 		 375 aa  57  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  25.49 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  38.3 
 
 		 372 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  42.67 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  34 
 
 		 355 aa  53.5  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  33.65 
 
 		 368 aa  53.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  36.78 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  33.68 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  35.29 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  35.29 
 
 		 376 aa  50.4  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  22.8 
 
 		 380 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  32.58 
 
 		 374 aa  49.7  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  34.09 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  38.55 
 
 		 385 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  34.91 
 
 		 358 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  28.1 
 
 		 381 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  30.48 
 
 		 374 aa  46.6  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  21.14 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1661  hypothetical protein  33.33 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.498777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  37.88 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>