51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3263 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  758    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  42.49 
 
 
381 aa  293  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  41.4 
 
 
371 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  38.89 
 
 
380 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  36.29 
 
 
378 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  36.03 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  36.22 
 
 
378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  35.64 
 
 
395 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  35.77 
 
 
395 aa  210  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  36.97 
 
 
378 aa  202  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  35.68 
 
 
400 aa  202  9e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  36.36 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  34.73 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  36.36 
 
 
384 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  35.86 
 
 
387 aa  200  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  34.47 
 
 
384 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  35.05 
 
 
380 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  33.85 
 
 
384 aa  196  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  35.88 
 
 
395 aa  196  7e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  35.75 
 
 
394 aa  196  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  35.39 
 
 
368 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  29.74 
 
 
366 aa  165  9e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  30.21 
 
 
375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  32.73 
 
 
376 aa  163  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  30.87 
 
 
384 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  30.42 
 
 
364 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  31.27 
 
 
358 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  31.51 
 
 
372 aa  157  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  30.03 
 
 
385 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  34.09 
 
 
372 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  31.46 
 
 
411 aa  150  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  31.67 
 
 
370 aa  140  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  30.42 
 
 
373 aa  135  9e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  31.01 
 
 
374 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  38.46 
 
 
423 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  29.32 
 
 
423 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  26.65 
 
 
358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  26.53 
 
 
377 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  32.85 
 
 
363 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  28.68 
 
 
389 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  25.93 
 
 
374 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  29.24 
 
 
355 aa  94.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  24.64 
 
 
399 aa  90.1  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  27.81 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  25.4 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  25 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  28.45 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4992  hypothetical protein  24.2 
 
 
395 aa  63.2  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1233  hypothetical protein  22.8 
 
 
401 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.460296  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5069  hypothetical protein  32.46 
 
 
390 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.511393  normal  0.074715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2036  hypothetical protein  27.97 
 
 
404 aa  43.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997579  normal  0.0998645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>