53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6602 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  100 
 
 		 381 aa  764    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  63.44 
 
 		 371 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  47.8 
 
 		 380 aa  299  5e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  42.49 
 
 		 380 aa  293  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  45.1 
 
 		 384 aa  288  9e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  45.64 
 
 		 384 aa  288  9e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  44.68 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  44.85 
 
 		 384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  44.47 
 
 		 384 aa  281  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  44.25 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  44.36 
 
 		 395 aa  279  5e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  44.17 
 
 		 378 aa  276  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  43.68 
 
 		 395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  42.52 
 
 		 378 aa  273  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  44.17 
 
 		 395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  43.58 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  41.4 
 
 		 400 aa  256  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  41.42 
 
 		 394 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  41.32 
 
 		 387 aa  247  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  39.13 
 
 		 411 aa  219  8.999999999999998e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  35.41 
 
 		 380 aa  209  5e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  34.97 
 
 		 372 aa  204  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  38.92 
 
 		 375 aa  199  9e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  33.67 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  38.2 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  31.28 
 
 		 368 aa  186  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  34.97 
 
 		 372 aa  180  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  34.32 
 
 		 385 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  35.75 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  38.89 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  31.48 
 
 		 364 aa  172  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  30.85 
 
 		 423 aa  163  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  40.31 
 
 		 374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  35.67 
 
 		 374 aa  159  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  30.64 
 
 		 423 aa  159  8e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  30.08 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  32.75 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  31.47 
 
 		 370 aa  133  6e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  34.98 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  31.75 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  29.35 
 
 		 349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  31.18 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  28.92 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  28.8 
 
 		 378 aa  109  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  29.83 
 
 		 389 aa  99.8  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  30.39 
 
 		 379 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  28.5 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4992  hypothetical protein  22.78 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  26.45 
 
 		 573 aa  57  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.328812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2036  hypothetical protein  25.2 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997579  normal  0.0998645 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5069  hypothetical protein  27.78 
 
 		 390 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.511393  normal  0.074715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1233  hypothetical protein  27.27 
 
 		 401 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.460296  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2702  hypothetical protein  28.95 
 
 		 390 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.523267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>