48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3014 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  90.38 
 
 		 395 aa  698    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  86.95 
 
 		 384 aa  658    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  87.73 
 
 		 384 aa  662    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  87.73 
 
 		 384 aa  662    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  86.77 
 
 		 384 aa  647    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  87.31 
 
 		 387 aa  658    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  97.22 
 
 		 395 aa  746    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  786    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  97.72 
 
 		 395 aa  749    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  73.67 
 
 		 378 aa  560  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  71.54 
 
 		 378 aa  530  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  72.53 
 
 		 378 aa  531  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  70.8 
 
 		 387 aa  522  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  67.55 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  62.97 
 
 		 400 aa  490  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  44.17 
 
 		 381 aa  283  5.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  41.11 
 
 		 371 aa  264  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  40.05 
 
 		 380 aa  256  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  37.24 
 
 		 380 aa  226  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  36.8 
 
 		 411 aa  169  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  34.12 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  31.5 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  33.16 
 
 		 375 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  30 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  30.33 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  31.93 
 
 		 358 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  30.31 
 
 		 366 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  35.8 
 
 		 370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  29.62 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  30.45 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  35.42 
 
 		 374 aa  143  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  30.33 
 
 		 376 aa  142  8e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  29.43 
 
 		 423 aa  139  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  30 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  32.2 
 
 		 373 aa  133  6e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  32.47 
 
 		 358 aa  129  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  29.23 
 
 		 374 aa  122  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  33.91 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  30.95 
 
 		 363 aa  106  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  26.51 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  30.63 
 
 		 355 aa  97.4  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  31.23 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  35.5 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  25.72 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  28.27 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  24.73 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  26.53 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  26.09 
 
 		 573 aa  61.2  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.328812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>