51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0502 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  100 
 
 
373 aa  751    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  32.64 
 
 
371 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  30.42 
 
 
380 aa  145  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  32.75 
 
 
381 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  32.64 
 
 
395 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  31.25 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  32.2 
 
 
395 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  31.2 
 
 
395 aa  133  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  31.58 
 
 
395 aa  133  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  30.71 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  35.42 
 
 
364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  30.59 
 
 
387 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  30.93 
 
 
384 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  30.39 
 
 
384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  30.93 
 
 
384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  31.83 
 
 
384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  30.97 
 
 
378 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  29.25 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  29.16 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  29.87 
 
 
380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  30.05 
 
 
384 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  28.68 
 
 
378 aa  116  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  27.55 
 
 
375 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  31.82 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  30 
 
 
394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  29.47 
 
 
411 aa  109  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  30.59 
 
 
377 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  28.57 
 
 
366 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  30.21 
 
 
374 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  28.57 
 
 
372 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  34.27 
 
 
374 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  30.4 
 
 
370 aa  95.9  9e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  31.53 
 
 
399 aa  94.4  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  30.91 
 
 
372 aa  93.2  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  28 
 
 
376 aa  92.8  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  27.15 
 
 
378 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  24.71 
 
 
423 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  27.85 
 
 
349 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  30.64 
 
 
385 aa  86.7  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  28.17 
 
 
358 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  27.02 
 
 
389 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  26.02 
 
 
358 aa  80.1  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  25.27 
 
 
423 aa  76.6  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  26.1 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  26.23 
 
 
363 aa  56.6  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4992  hypothetical protein  32.77 
 
 
395 aa  52.8  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  25.71 
 
 
355 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  25.5 
 
 
388 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  26.84 
 
 
573 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.328812 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1661  hypothetical protein  32.38 
 
 
346 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.498777  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5069  hypothetical protein  38.75 
 
 
390 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.511393  normal  0.074715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>