54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6587 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  100 
 
 
364 aa  727    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  69.64 
 
 
368 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  44.86 
 
 
358 aa  276  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  43.39 
 
 
384 aa  257  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  41.07 
 
 
380 aa  256  4e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  43.48 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  36.68 
 
 
372 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  33.25 
 
 
423 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  34.76 
 
 
423 aa  215  9e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  36.68 
 
 
372 aa  212  7e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  36.99 
 
 
366 aa  212  7.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  38.52 
 
 
374 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  34.49 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  34.52 
 
 
358 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  32 
 
 
376 aa  178  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  31.48 
 
 
381 aa  172  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  31.17 
 
 
371 aa  169  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  33.12 
 
 
380 aa  166  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  34.21 
 
 
395 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  30.42 
 
 
380 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  35.08 
 
 
395 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  33.16 
 
 
378 aa  159  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  33.42 
 
 
384 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  34.12 
 
 
395 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  31.4 
 
 
378 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  33.42 
 
 
384 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  33.42 
 
 
387 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  33.42 
 
 
384 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  33.33 
 
 
395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  32.44 
 
 
363 aa  150  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  32.89 
 
 
384 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  31.84 
 
 
378 aa  146  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  32.69 
 
 
411 aa  146  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  28.46 
 
 
374 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  34.23 
 
 
355 aa  139  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  32.6 
 
 
377 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  31.78 
 
 
394 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  31.43 
 
 
387 aa  132  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  30.61 
 
 
400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  35.42 
 
 
373 aa  125  8.000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  29.63 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  28.07 
 
 
399 aa  110  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  27.37 
 
 
349 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  25.47 
 
 
370 aa  87.8  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  27.78 
 
 
378 aa  86.3  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  26.18 
 
 
389 aa  82.8  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  27.7 
 
 
379 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  30.94 
 
 
573 aa  78.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.328812 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4992  hypothetical protein  21.88 
 
 
395 aa  56.6  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1233  hypothetical protein  33.68 
 
 
401 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.460296  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5069  hypothetical protein  31.31 
 
 
390 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.511393  normal  0.074715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2036  hypothetical protein  31.58 
 
 
404 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997579  normal  0.0998645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2702  hypothetical protein  32.98 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.523267 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1452  protein of unknown function DUF1624  29.27 
 
 
411 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>