48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1103 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  783    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  65.32 
 
 
395 aa  503  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  67.55 
 
 
395 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  67.28 
 
 
395 aa  500  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  66.05 
 
 
378 aa  500  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  68.02 
 
 
384 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  68.02 
 
 
384 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  66.76 
 
 
395 aa  497  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  67.48 
 
 
384 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  67.2 
 
 
384 aa  497  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  67.47 
 
 
387 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  67.8 
 
 
387 aa  489  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  66.84 
 
 
378 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  63.66 
 
 
378 aa  471  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  57.61 
 
 
400 aa  434  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  41.42 
 
 
381 aa  266  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  38.73 
 
 
371 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  38.67 
 
 
380 aa  228  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  36.15 
 
 
380 aa  206  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  35.89 
 
 
411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  32.92 
 
 
375 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  31.47 
 
 
368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  31.75 
 
 
366 aa  141  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  32.56 
 
 
364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  29.01 
 
 
372 aa  140  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  30.46 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  28.46 
 
 
372 aa  134  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  33.63 
 
 
374 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  34.75 
 
 
370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  28.38 
 
 
423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  30.02 
 
 
385 aa  126  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  29.27 
 
 
423 aa  122  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  29.87 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  30.5 
 
 
373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  28.89 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  29.52 
 
 
358 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  31.36 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  27.55 
 
 
358 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  28.61 
 
 
349 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  29.06 
 
 
355 aa  95.9  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  28.83 
 
 
363 aa  94.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  30.27 
 
 
379 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  30.68 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  27.29 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  27 
 
 
389 aa  76.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  25.97 
 
 
377 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  22.81 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  22.52 
 
 
573 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.328812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>