48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1214 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  751    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  79.1 
 
 		 378 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  72.53 
 
 		 395 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  71.54 
 
 		 384 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  72 
 
 		 395 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  71.28 
 
 		 384 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  71.54 
 
 		 384 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  70.98 
 
 		 387 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  71.47 
 
 		 395 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  70.98 
 
 		 395 aa  529  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  70.21 
 
 		 384 aa  530  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  69.05 
 
 		 378 aa  512  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  69.9 
 
 		 387 aa  508  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  66.84 
 
 		 394 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  62.13 
 
 		 400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  43.58 
 
 		 381 aa  279  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  40.71 
 
 		 380 aa  261  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  40.32 
 
 		 371 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  36.58 
 
 		 380 aa  216  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  36.56 
 
 		 411 aa  176  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  32.82 
 
 		 380 aa  170  3e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  32.05 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  32.86 
 
 		 375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  29.46 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  36.39 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  31.47 
 
 		 366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  31.85 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  30.95 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  30.73 
 
 		 376 aa  147  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  31.16 
 
 		 384 aa  146  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  28.76 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  28.93 
 
 		 423 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  35.88 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  31.06 
 
 		 385 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  28.69 
 
 		 423 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  30.97 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  28.12 
 
 		 358 aa  116  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  25.88 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  28.12 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  30.55 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  28.4 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  28.39 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  28.68 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  29.76 
 
 		 379 aa  92.8  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  25.81 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  25.33 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  27.62 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1640  hypothetical protein  20.36 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>