54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1515 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  742    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  58.67 
 
 
375 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  53.72 
 
 
376 aa  383  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  41.44 
 
 
380 aa  298  1e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  42.97 
 
 
384 aa  287  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  44.72 
 
 
385 aa  283  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  41.42 
 
 
358 aa  275  8e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  36.21 
 
 
423 aa  253  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  39.35 
 
 
358 aa  247  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  37.29 
 
 
423 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  37.14 
 
 
374 aa  236  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  39.07 
 
 
372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  41.12 
 
 
368 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  39.07 
 
 
372 aa  223  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  36.99 
 
 
364 aa  223  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  42.72 
 
 
374 aa  206  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  35.66 
 
 
363 aa  192  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  39.63 
 
 
381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  38.79 
 
 
380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  33.6 
 
 
355 aa  182  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  34.43 
 
 
378 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  29.74 
 
 
380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  33.69 
 
 
388 aa  171  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  32.7 
 
 
377 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  33.42 
 
 
371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  32.31 
 
 
378 aa  156  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  31.25 
 
 
378 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  32.56 
 
 
395 aa  149  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  31.55 
 
 
384 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  30.31 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  31.27 
 
 
395 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  30.83 
 
 
395 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  29.69 
 
 
400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  31.55 
 
 
384 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  30.59 
 
 
399 aa  146  7.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  31.82 
 
 
387 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  30.61 
 
 
384 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  31.38 
 
 
387 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  30.23 
 
 
384 aa  137  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  30.5 
 
 
394 aa  136  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  29.57 
 
 
411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  28.57 
 
 
373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  28.3 
 
 
370 aa  114  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  26.37 
 
 
389 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  27.15 
 
 
379 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  27.62 
 
 
573 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.328812 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  24.66 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  27.51 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1233  hypothetical protein  33.66 
 
 
401 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.460296  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5069  hypothetical protein  30.19 
 
 
390 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.511393  normal  0.074715 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4992  hypothetical protein  31.78 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1661  hypothetical protein  29.01 
 
 
346 aa  49.3  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.498777  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2036  hypothetical protein  30 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997579  normal  0.0998645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2702  hypothetical protein  31.18 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.523267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>