32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4992 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4992  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  791    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5069  hypothetical protein  37.37 
 
 
390 aa  235  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.511393  normal  0.074715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2036  hypothetical protein  33.99 
 
 
404 aa  213  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997579  normal  0.0998645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1233  hypothetical protein  33.42 
 
 
401 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.460296  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2702  hypothetical protein  33.42 
 
 
390 aa  193  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.523267 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  25.99 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  25.41 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  24.73 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  24.2 
 
 
380 aa  63.2  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  38.67 
 
 
399 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  23.01 
 
 
368 aa  60.1  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  31.58 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  32.99 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  22.78 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  37.62 
 
 
377 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  24.65 
 
 
358 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  32 
 
 
573 aa  58.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.328812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  21.88 
 
 
364 aa  56.6  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  35.42 
 
 
355 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  36.47 
 
 
376 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  36.05 
 
 
372 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  23.25 
 
 
384 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  43.48 
 
 
374 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  33.68 
 
 
375 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  32.77 
 
 
373 aa  52.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  48.33 
 
 
372 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  35.71 
 
 
358 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  34.69 
 
 
388 aa  51.2  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  34.83 
 
 
385 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  35.29 
 
 
366 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  29.52 
 
 
374 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  32.99 
 
 
363 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>