52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0458 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  759    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  29.29 
 
 		 388 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2897  hypothetical protein  28.61 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.905704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  28.97 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  26.97 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3280  hypothetical protein  29.52 
 
 		 407 aa  123  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515764  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1535  hypothetical protein  28.29 
 
 		 398 aa  123  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000132608  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  28.12 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  29.33 
 
 		 382 aa  119  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  28.39 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  28.93 
 
 		 382 aa  117  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3048  hypothetical protein  28.53 
 
 		 440 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.634245  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1866  hypothetical protein  28.39 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.574386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4226  membrane protein-like protein  26.46 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3696  membrane protein-like protein  29.66 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643247  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0666  hypothetical protein  29.06 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  28.3 
 
 		 418 aa  111  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5717  hypothetical protein  25.6 
 
 		 398 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2951  hypothetical protein  27.41 
 
 		 402 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  28.97 
 
 		 398 aa  109  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1300  hypothetical protein  27.25 
 
 		 388 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  28.19 
 
 		 428 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  28.19 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  28.86 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0455  membrane protein-like protein  27.69 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  29.8 
 
 		 401 aa  106  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  28.64 
 
 		 382 aa  106  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  27.99 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  27.05 
 
 		 392 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  29.08 
 
 		 401 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  27.59 
 
 		 437 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5189  hypothetical protein  28.17 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1089  protein of unknown function DUF1624  28.13 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  29.86 
 
 		 401 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1726  hypothetical protein  25.53 
 
 		 408 aa  99.8  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  27.66 
 
 		 388 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0794  membrane protein-like protein  28.21 
 
 		 388 aa  96.3  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3588  hypothetical protein  23.9 
 
 		 407 aa  94  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0967112  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1471  hypothetical protein  25.19 
 
 		 383 aa  90.1  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.430676  normal  0.785937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  28.96 
 
 		 388 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  29.88 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0289  membrane protein  27.03 
 
 		 399 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5557  hypothetical protein  29.08 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  29.25 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2111  hypothetical protein  29.5 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63970  hypothetical protein  28.64 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.989357 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  28.07 
 
 		 421 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  28.63 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  25 
 
 		 249 aa  53.9  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  25.34 
 
 		 246 aa  53.5  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  28.1 
 
 		 349 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4532  transport protein  20.69 
 
 		 354 aa  43.1  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>