49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3464 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  98.04 
 
 
428 aa  780    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  100 
 
 
424 aa  855    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  93.06 
 
 
437 aa  758    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  86.54 
 
 
418 aa  701    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  96.33 
 
 
426 aa  770    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  75.89 
 
 
388 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  76.25 
 
 
401 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  77.49 
 
 
401 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  73.85 
 
 
401 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  46.94 
 
 
388 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  48.85 
 
 
388 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  46.55 
 
 
388 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  46.12 
 
 
382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  49.62 
 
 
382 aa  305  7e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3280  hypothetical protein  47.83 
 
 
407 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515764  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  45.52 
 
 
382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2951  hypothetical protein  44.95 
 
 
402 aa  301  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5189  hypothetical protein  46.94 
 
 
429 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  49.62 
 
 
388 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3696  membrane protein-like protein  44.84 
 
 
397 aa  299  8e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643247  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1866  hypothetical protein  46.8 
 
 
405 aa  296  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.574386  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1089  protein of unknown function DUF1624  47.45 
 
 
382 aa  291  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  49.1 
 
 
388 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  44.22 
 
 
382 aa  286  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  48.15 
 
 
398 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5557  hypothetical protein  51.4 
 
 
384 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  47.45 
 
 
421 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63970  hypothetical protein  50.77 
 
 
384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.989357 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  44.27 
 
 
385 aa  252  7e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  51.61 
 
 
387 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2111  hypothetical protein  45.64 
 
 
392 aa  249  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  37.5 
 
 
401 aa  243  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2897  hypothetical protein  36.7 
 
 
390 aa  216  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.905704  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1300  hypothetical protein  36.76 
 
 
388 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5717  hypothetical protein  34.8 
 
 
398 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  34.47 
 
 
414 aa  199  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1535  hypothetical protein  38.06 
 
 
398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000132608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1726  hypothetical protein  33.03 
 
 
408 aa  193  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0289  membrane protein  34.77 
 
 
399 aa  187  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0666  hypothetical protein  36.13 
 
 
388 aa  177  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3588  hypothetical protein  33.69 
 
 
407 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0967112  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3048  hypothetical protein  36.19 
 
 
440 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.634245  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  32.84 
 
 
392 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  28.43 
 
 
375 aa  117  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1471  hypothetical protein  28.69 
 
 
383 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.430676  normal  0.785937 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4226  membrane protein-like protein  25.12 
 
 
389 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0794  membrane protein-like protein  27.02 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0455  membrane protein-like protein  26.18 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  25.24 
 
 
246 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>