49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1089 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1089  protein of unknown function DUF1624  100 
 
 		 382 aa  749    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  56.32 
 
 		 388 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  56.54 
 
 		 388 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  61.52 
 
 		 388 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  55.09 
 
 		 382 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  62.07 
 
 		 382 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3280  hypothetical protein  59.47 
 
 		 407 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515764  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  61.52 
 
 		 388 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1866  hypothetical protein  61.11 
 
 		 405 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.574386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  56.4 
 
 		 382 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  62.57 
 
 		 388 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2951  hypothetical protein  53.83 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  60.99 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5189  hypothetical protein  56.66 
 
 		 429 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5557  hypothetical protein  61.56 
 
 		 384 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63970  hypothetical protein  61.3 
 
 		 384 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.989357 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  54.11 
 
 		 382 aa  335  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3696  membrane protein-like protein  51.97 
 
 		 397 aa  326  4.0000000000000003e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  49.87 
 
 		 388 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  50 
 
 		 401 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  49.23 
 
 		 401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  47.83 
 
 		 428 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  49.48 
 
 		 401 aa  305  6e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  47.57 
 
 		 424 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  46.94 
 
 		 418 aa  301  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  47.06 
 
 		 426 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  46.08 
 
 		 437 aa  298  9e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  55.06 
 
 		 398 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  51.47 
 
 		 385 aa  273  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2111  hypothetical protein  54.92 
 
 		 392 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  40.71 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  57.93 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5717  hypothetical protein  37.06 
 
 		 398 aa  241  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  38.25 
 
 		 414 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2897  hypothetical protein  39.54 
 
 		 390 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.905704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1300  hypothetical protein  38.12 
 
 		 388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1726  hypothetical protein  35.59 
 
 		 408 aa  202  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1535  hypothetical protein  39.39 
 
 		 398 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000132608  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0289  membrane protein  35.5 
 
 		 399 aa  190  5e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3048  hypothetical protein  41.67 
 
 		 440 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.634245  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0666  hypothetical protein  41.18 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3588  hypothetical protein  35.63 
 
 		 407 aa  169  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0967112  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  29.9 
 
 		 392 aa  143  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  28.13 
 
 		 375 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4226  membrane protein-like protein  31.71 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0794  membrane protein-like protein  30.65 
 
 		 388 aa  96.3  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0455  membrane protein-like protein  31.14 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1471  hypothetical protein  27.19 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.430676  normal  0.785937 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1006  hypothetical protein  24.38 
 
 		 355 aa  49.7  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>