52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2213 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  786    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3048  hypothetical protein  34.25 
 
 		 440 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.634245  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0666  hypothetical protein  32.42 
 
 		 388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  31.85 
 
 		 401 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  34.15 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  30.87 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1300  hypothetical protein  34.05 
 
 		 388 aa  159  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0289  membrane protein  32.9 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  36.93 
 
 		 382 aa  155  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  29.92 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  34.81 
 
 		 437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  35.81 
 
 		 418 aa  152  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  34.13 
 
 		 424 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1726  hypothetical protein  33.33 
 
 		 408 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  34.81 
 
 		 426 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2897  hypothetical protein  30.92 
 
 		 390 aa  149  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.905704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  33.79 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  33.78 
 
 		 401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  34.12 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  30.58 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  33.01 
 
 		 401 aa  142  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3280  hypothetical protein  29.95 
 
 		 407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515764  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5189  hypothetical protein  31.17 
 
 		 429 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  29.43 
 
 		 414 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  31.25 
 
 		 382 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3588  hypothetical protein  29.07 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0967112  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2951  hypothetical protein  29.87 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  29.68 
 
 		 398 aa  133  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1535  hypothetical protein  31.31 
 
 		 398 aa  133  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000132608  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5717  hypothetical protein  30.68 
 
 		 398 aa  132  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  29.1 
 
 		 388 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  35.33 
 
 		 387 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  35.46 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  34.49 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  35.13 
 
 		 421 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  29.15 
 
 		 382 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  32.01 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1866  hypothetical protein  28.28 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.574386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1089  protein of unknown function DUF1624  30.4 
 
 		 382 aa  117  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3696  membrane protein-like protein  28.09 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63970  hypothetical protein  30.48 
 
 		 384 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.989357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5557  hypothetical protein  29.22 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  27.05 
 
 		 375 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2111  hypothetical protein  35.09 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4226  membrane protein-like protein  24.63 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0794  membrane protein-like protein  25.61 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0455  membrane protein-like protein  25.68 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  27.19 
 
 		 249 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1006  hypothetical protein  25.54 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  24.41 
 
 		 235 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  26.75 
 
 		 246 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1471  hypothetical protein  22.91 
 
 		 383 aa  43.1  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.430676  normal  0.785937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>