48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2880 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  87.62 
 
 		 426 aa  703    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  87.14 
 
 		 428 aa  702    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  842    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  85.48 
 
 		 437 aa  692    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  86.54 
 
 		 424 aa  702    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  74.16 
 
 		 401 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  73.27 
 
 		 401 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  74.56 
 
 		 388 aa  560  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  73.44 
 
 		 401 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  49.87 
 
 		 388 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  47.34 
 
 		 388 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  47.21 
 
 		 388 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3280  hypothetical protein  47.45 
 
 		 407 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515764  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  47.33 
 
 		 382 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2951  hypothetical protein  46.21 
 
 		 402 aa  302  7.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  49.87 
 
 		 388 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1866  hypothetical protein  45.11 
 
 		 405 aa  291  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.574386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1089  protein of unknown function DUF1624  46.94 
 
 		 382 aa  290  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  44.81 
 
 		 382 aa  290  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5189  hypothetical protein  47.22 
 
 		 429 aa  289  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3696  membrane protein-like protein  43.46 
 
 		 397 aa  289  7e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643247  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  47.99 
 
 		 382 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  45.8 
 
 		 382 aa  286  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  49.1 
 
 		 388 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  49.15 
 
 		 398 aa  286  7e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5557  hypothetical protein  51.91 
 
 		 384 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  48.08 
 
 		 421 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63970  hypothetical protein  51.02 
 
 		 384 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.989357 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  45.2 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2111  hypothetical protein  45.27 
 
 		 392 aa  246  8e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  44.97 
 
 		 387 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  37.96 
 
 		 401 aa  230  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1300  hypothetical protein  37.62 
 
 		 388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5717  hypothetical protein  34.4 
 
 		 398 aa  208  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2897  hypothetical protein  35.71 
 
 		 390 aa  206  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.905704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1726  hypothetical protein  34.42 
 
 		 408 aa  193  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  33.41 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1535  hypothetical protein  37.47 
 
 		 398 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000132608  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0289  membrane protein  34.76 
 
 		 399 aa  176  8e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0666  hypothetical protein  35.33 
 
 		 388 aa  169  8e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3048  hypothetical protein  35.71 
 
 		 440 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.634245  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3588  hypothetical protein  33.06 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0967112  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  32.11 
 
 		 392 aa  146  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  28.3 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1471  hypothetical protein  28.38 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.430676  normal  0.785937 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4226  membrane protein-like protein  25 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0794  membrane protein-like protein  26.85 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0455  membrane protein-like protein  24.88 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>