48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1535 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1535  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  791    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000132608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3588  hypothetical protein  42.89 
 
 
407 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0967112  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1726  hypothetical protein  39.33 
 
 
408 aa  257  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  41.56 
 
 
401 aa  256  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2897  hypothetical protein  41.77 
 
 
390 aa  250  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.905704  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5717  hypothetical protein  38.77 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  38.69 
 
 
388 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  38.5 
 
 
414 aa  237  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  39.04 
 
 
388 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  38.97 
 
 
382 aa  225  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1300  hypothetical protein  36.07 
 
 
388 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0289  membrane protein  38.46 
 
 
399 aa  216  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3280  hypothetical protein  38.27 
 
 
407 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515764  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  41.34 
 
 
382 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2951  hypothetical protein  37.97 
 
 
402 aa  209  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  37.78 
 
 
382 aa  206  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  43.12 
 
 
388 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  43.44 
 
 
398 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  38.37 
 
 
437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  38.06 
 
 
426 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  37.81 
 
 
428 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  38.06 
 
 
424 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5557  hypothetical protein  42.96 
 
 
384 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  38.52 
 
 
382 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  39.61 
 
 
401 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1089  protein of unknown function DUF1624  39.55 
 
 
382 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  40.67 
 
 
401 aa  190  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  37.47 
 
 
418 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3696  membrane protein-like protein  37.47 
 
 
397 aa  189  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643247  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1866  hypothetical protein  39.04 
 
 
405 aa  189  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.574386  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  40.55 
 
 
385 aa  189  9e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  39.03 
 
 
388 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  38.94 
 
 
401 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5189  hypothetical protein  38.92 
 
 
429 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  38.9 
 
 
388 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3048  hypothetical protein  37.61 
 
 
440 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.634245  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  38.9 
 
 
388 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63970  hypothetical protein  40.92 
 
 
384 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.989357 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0666  hypothetical protein  35.53 
 
 
388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  44.67 
 
 
387 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2111  hypothetical protein  42.24 
 
 
392 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  37.5 
 
 
421 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  30.96 
 
 
392 aa  144  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  27.8 
 
 
375 aa  133  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4226  membrane protein-like protein  26.87 
 
 
389 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1471  hypothetical protein  28.37 
 
 
383 aa  87.8  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.430676  normal  0.785937 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0455  membrane protein-like protein  27.87 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0794  membrane protein-like protein  25.44 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>