49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1081 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  93.05 
 
 
437 aa  756    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  86.6 
 
 
418 aa  709    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  96.82 
 
 
426 aa  775    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  96.73 
 
 
424 aa  799    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  100 
 
 
428 aa  866    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  76.5 
 
 
401 aa  578  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  75.89 
 
 
388 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  77.49 
 
 
401 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  73.49 
 
 
401 aa  566  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  49.87 
 
 
388 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  47.19 
 
 
388 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  46.8 
 
 
388 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  46.37 
 
 
382 aa  312  7.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3280  hypothetical protein  48.34 
 
 
407 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515764  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  50.38 
 
 
388 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  49.62 
 
 
382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  45.01 
 
 
382 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5189  hypothetical protein  43.35 
 
 
429 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2951  hypothetical protein  44.44 
 
 
402 aa  299  5e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1866  hypothetical protein  46.55 
 
 
405 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.574386  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  49.87 
 
 
388 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1089  protein of unknown function DUF1624  47.83 
 
 
382 aa  293  4e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3696  membrane protein-like protein  44.08 
 
 
397 aa  292  6e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643247  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5557  hypothetical protein  52.55 
 
 
384 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  49.14 
 
 
398 aa  291  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  44.72 
 
 
382 aa  290  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  48.59 
 
 
421 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63970  hypothetical protein  51.79 
 
 
384 aa  279  8e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.989357 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  44.78 
 
 
385 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  44.67 
 
 
387 aa  249  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2111  hypothetical protein  45.38 
 
 
392 aa  249  9e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  37.98 
 
 
401 aa  243  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2897  hypothetical protein  36.45 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.905704  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1300  hypothetical protein  36.76 
 
 
388 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5717  hypothetical protein  34.15 
 
 
398 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1535  hypothetical protein  38.06 
 
 
398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000132608  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  33.98 
 
 
414 aa  196  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1726  hypothetical protein  32.95 
 
 
408 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0289  membrane protein  35.06 
 
 
399 aa  188  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0666  hypothetical protein  36.13 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3588  hypothetical protein  30.55 
 
 
407 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0967112  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3048  hypothetical protein  36.76 
 
 
440 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.634245  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  30.37 
 
 
392 aa  144  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  28.43 
 
 
375 aa  116  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1471  hypothetical protein  28.96 
 
 
383 aa  91.3  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.430676  normal  0.785937 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4226  membrane protein-like protein  24.76 
 
 
389 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0794  membrane protein-like protein  26.2 
 
 
388 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0455  membrane protein-like protein  26.43 
 
 
389 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1450  hypothetical protein  28.77 
 
 
411 aa  43.1  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>