41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1450 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1450  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  793    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1452  protein of unknown function DUF1624  73.83 
 
 		 411 aa  580  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3077  hypothetical protein  44.01 
 
 		 404 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0644  hypothetical protein  34.55 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353612  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20080  predicted membrane protein  40.33 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0149559 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1481  hypothetical protein  36.91 
 
 		 378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526682  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3869  hypothetical protein  38.75 
 
 		 385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0435346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3252  hypothetical protein  32.05 
 
 		 432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3181  hypothetical protein  36.31 
 
 		 371 aa  130  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09280  hypothetical protein  33.56 
 
 		 313 aa  129  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07140  predicted membrane protein  35.96 
 
 		 423 aa  129  7.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.125251  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2244  hypothetical protein  33.52 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2675  hypothetical protein  29.37 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2368  hypothetical protein  33.92 
 
 		 402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1542  hypothetical protein  31.21 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36310  hypothetical protein  34.25 
 
 		 427 aa  110  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1560  hypothetical protein  34.87 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0858  hypothetical protein  37.4 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.581256  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0333  hypothetical protein  37.84 
 
 		 538 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.115307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2673  hypothetical protein  33.62 
 
 		 434 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0991  hypothetical protein  29.22 
 
 		 362 aa  86.7  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1197  hypothetical protein  31.83 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.673489  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4532  transport protein  29.63 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3325  hypothetical protein  29.67 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0514676  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2187  hypothetical protein  25.58 
 
 		 361 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2015  hypothetical protein  24.33 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0652327  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0017  hypothetical protein  30.08 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18000  hypothetical protein  28.41 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.514365  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1720  transport protein  26.67 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06780  hypothetical protein  31.41 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  29.32 
 
 		 368 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1006  hypothetical protein  27.31 
 
 		 355 aa  50.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  28.26 
 
 		 428 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  27.32 
 
 		 245 aa  46.6  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  27.83 
 
 		 437 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  26.96 
 
 		 418 aa  46.6  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  29.53 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  25.47 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  27.39 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  26.72 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  28.12 
 
 		 424 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0282982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>