31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2244 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2244  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  865    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3252  hypothetical protein  49.05 
 
 		 432 aa  306  6e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1542  hypothetical protein  40.36 
 
 		 445 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2675  hypothetical protein  38.35 
 
 		 434 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3181  hypothetical protein  41.25 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2368  hypothetical protein  39.32 
 
 		 402 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3325  hypothetical protein  41.69 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0514676  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2673  hypothetical protein  35.68 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1560  hypothetical protein  34.31 
 
 		 382 aa  150  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3077  hypothetical protein  37.76 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0644  hypothetical protein  38.81 
 
 		 412 aa  146  9e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353612  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1197  hypothetical protein  36.86 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.673489  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09280  hypothetical protein  37.25 
 
 		 313 aa  143  8e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1452  protein of unknown function DUF1624  32.46 
 
 		 411 aa  131  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1450  hypothetical protein  32.76 
 
 		 411 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1481  hypothetical protein  34.79 
 
 		 378 aa  127  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526682  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06780  hypothetical protein  32.74 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0333  hypothetical protein  36.76 
 
 		 538 aa  109  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.115307 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0991  hypothetical protein  32.23 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3869  hypothetical protein  33.76 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0435346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07140  predicted membrane protein  35.71 
 
 		 423 aa  97.1  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.125251  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20080  predicted membrane protein  33.53 
 
 		 450 aa  96.3  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0149559 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2015  hypothetical protein  24.14 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0652327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2187  hypothetical protein  24.27 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0858  hypothetical protein  36.58 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.581256  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36310  hypothetical protein  33.52 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0017  hypothetical protein  27.43 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4532  transport protein  28.17 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1720  transport protein  32.84 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18000  hypothetical protein  35.57 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.514365  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  26.07 
 
 		 270 aa  44.3  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>