30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0991 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0991  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  698    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1560  hypothetical protein  33.24 
 
 		 382 aa  112  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2368  hypothetical protein  31.18 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1542  hypothetical protein  31.39 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2673  hypothetical protein  29.59 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2244  hypothetical protein  32.23 
 
 		 450 aa  99  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3181  hypothetical protein  32.36 
 
 		 371 aa  97.4  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2015  hypothetical protein  27.55 
 
 		 361 aa  96.3  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0652327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2675  hypothetical protein  29.04 
 
 		 434 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1481  hypothetical protein  29.48 
 
 		 378 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526682  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3077  hypothetical protein  32.89 
 
 		 404 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0644  hypothetical protein  31.85 
 
 		 412 aa  87.4  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2187  hypothetical protein  28.38 
 
 		 361 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3252  hypothetical protein  32.52 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1452  protein of unknown function DUF1624  29.62 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0017  hypothetical protein  28.49 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1197  hypothetical protein  31.91 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.673489  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09280  hypothetical protein  30.38 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3325  hypothetical protein  36.41 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0514676  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07140  predicted membrane protein  34.1 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.125251  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1450  hypothetical protein  28.42 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0333  hypothetical protein  29.35 
 
 		 538 aa  68.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.115307 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3869  hypothetical protein  34.3 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0435346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20080  predicted membrane protein  27.96 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0149559 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06780  hypothetical protein  31.55 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4532  transport protein  26.13 
 
 		 354 aa  57  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1720  transport protein  27.09 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36310  hypothetical protein  28.12 
 
 		 427 aa  50.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18000  hypothetical protein  30.48 
 
 		 405 aa  46.6  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.514365  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0858  hypothetical protein  27.19 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.581256  normal  0.122318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>