31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1197 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1197  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  736    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.673489  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1560  hypothetical protein  44.72 
 
 
382 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3181  hypothetical protein  41.41 
 
 
371 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2368  hypothetical protein  41.05 
 
 
402 aa  163  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2244  hypothetical protein  37.4 
 
 
450 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3252  hypothetical protein  34.25 
 
 
432 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2675  hypothetical protein  32.67 
 
 
434 aa  135  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1542  hypothetical protein  34.9 
 
 
445 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2673  hypothetical protein  31.3 
 
 
434 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0333  hypothetical protein  36.18 
 
 
538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.115307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3325  hypothetical protein  35.71 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0514676  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0644  hypothetical protein  35.82 
 
 
412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353612  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1452  protein of unknown function DUF1624  32.28 
 
 
411 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3077  hypothetical protein  33.7 
 
 
404 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0991  hypothetical protein  33.14 
 
 
362 aa  94.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1450  hypothetical protein  31.3 
 
 
411 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06780  hypothetical protein  40.8 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09280  hypothetical protein  34.48 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1481  hypothetical protein  32.13 
 
 
378 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526682  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4532  transport protein  29.1 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20080  predicted membrane protein  37.06 
 
 
450 aa  71.6  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0149559 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07140  predicted membrane protein  51.82 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.125251  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2015  hypothetical protein  23.35 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0652327  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3869  hypothetical protein  39.25 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0435346  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2187  hypothetical protein  22.59 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0017  hypothetical protein  38.04 
 
 
374 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0858  hypothetical protein  29.31 
 
 
394 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.581256  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36310  hypothetical protein  29.09 
 
 
427 aa  50.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1720  transport protein  30.11 
 
 
344 aa  46.6  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  27.7 
 
 
388 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12320  hypothetical protein  30.52 
 
 
346 aa  43.5  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144184  normal  0.326836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>