31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_20080 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_20080  predicted membrane protein  100 
 
 		 450 aa  862    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0149559 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1452  protein of unknown function DUF1624  40.15 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1450  hypothetical protein  39.06 
 
 		 411 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0644  hypothetical protein  38.52 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353612  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3869  hypothetical protein  39.21 
 
 		 385 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0435346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3252  hypothetical protein  33.11 
 
 		 432 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1481  hypothetical protein  34.69 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526682  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1542  hypothetical protein  33.25 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2673  hypothetical protein  33.81 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3077  hypothetical protein  37.57 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09280  hypothetical protein  35.23 
 
 		 313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2244  hypothetical protein  31.48 
 
 		 450 aa  113  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2675  hypothetical protein  30.42 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0858  hypothetical protein  35.25 
 
 		 394 aa  103  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.581256  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2368  hypothetical protein  32.9 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0333  hypothetical protein  36.72 
 
 		 538 aa  101  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.115307 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07140  predicted membrane protein  37.53 
 
 		 423 aa  99.4  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.125251  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0991  hypothetical protein  27.7 
 
 		 362 aa  99  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4532  transport protein  33.59 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36310  hypothetical protein  33.06 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1560  hypothetical protein  31.53 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3181  hypothetical protein  38.5 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3325  hypothetical protein  32.29 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0514676  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1197  hypothetical protein  32.17 
 
 		 386 aa  69.7  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.673489  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1720  transport protein  30.43 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06780  hypothetical protein  32.8 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18000  hypothetical protein  28.81 
 
 		 405 aa  54.7  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.514365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2015  hypothetical protein  23.86 
 
 		 361 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0652327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2187  hypothetical protein  26.25 
 
 		 361 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  40.54 
 
 		 391 aa  44.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0017  hypothetical protein  25.81 
 
 		 374 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>