36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1720 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1720  transport protein  100 
 
 		 344 aa  663    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4532  transport protein  58.33 
 
 		 354 aa  360  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2187  hypothetical protein  36.01 
 
 		 361 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2015  hypothetical protein  33.8 
 
 		 361 aa  179  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0652327  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0017  hypothetical protein  34.54 
 
 		 374 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2675  hypothetical protein  30.59 
 
 		 434 aa  90.1  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3181  hypothetical protein  29.95 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09280  hypothetical protein  31.05 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1542  hypothetical protein  28.81 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07140  predicted membrane protein  31.47 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.125251  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0991  hypothetical protein  26.12 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2244  hypothetical protein  28.1 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0333  hypothetical protein  32.14 
 
 		 538 aa  64.7  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.115307 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2368  hypothetical protein  29.57 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2673  hypothetical protein  32.55 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3869  hypothetical protein  33.17 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0435346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1452  protein of unknown function DUF1624  28.24 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1560  hypothetical protein  27.35 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36310  hypothetical protein  28.01 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3252  hypothetical protein  31.75 
 
 		 432 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0644  hypothetical protein  34.65 
 
 		 412 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353612  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3077  hypothetical protein  30.56 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1450  hypothetical protein  28.74 
 
 		 411 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  29.3 
 
 		 459 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1481  hypothetical protein  31.99 
 
 		 378 aa  49.7  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526682  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  22.37 
 
 		 381 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  23.5 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  30.15 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20080  predicted membrane protein  29.97 
 
 		 450 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0149559 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  22.98 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1197  hypothetical protein  30 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.673489  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  24.87 
 
 		 387 aa  47  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3325  hypothetical protein  29.71 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0514676  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1492  hypothetical protein  23.53 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512867  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4874  protein of unknown function DUF418  35.65 
 
 		 456 aa  43.9  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  33.57 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>