96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4874 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4874  protein of unknown function DUF418  100 
 
 		 456 aa  868    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  30.75 
 
 		 414 aa  98.2  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1198  hypothetical protein  23.8 
 
 		 399 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1199  hypothetical protein  22.79 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  26.92 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  28 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  26.53 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  26.14 
 
 		 416 aa  69.7  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  38.79 
 
 		 430 aa  67  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0371  hypothetical protein  47.13 
 
 		 397 aa  67  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  23.19 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  40 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6573  hypothetical protein  43.82 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00469917  normal  0.0258575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  27.14 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.59 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.037271 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  21.59 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  23.08 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  23.94 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  22.22 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4882  hypothetical protein  31.91 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4858  hypothetical protein  31.91 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  30.62 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  29.44 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  23.13 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  22.64 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  22.76 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1304  hypothetical protein  21.57 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  21.92 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4889  hypothetical protein  33.68 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5203  conserved membrane spanning protein  28.72 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4479  membrane spanning protein  33.75 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4532  transport protein  28.76 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4868  hypothetical protein  34.15 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  23.22 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4497  membrane spanning protein  35.37 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  22.69 
 
 		 414 aa  57  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  20.7 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1492  hypothetical protein  21.04 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512867  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  22.92 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4644  hypothetical protein  34.15 
 
 		 340 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4998  hypothetical protein  34.15 
 
 		 340 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8802  hypothetical protein  32.25 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  20.2 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  23.14 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  27.81 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0609  hypothetical protein  29.5 
 
 		 787 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  38.46 
 
 		 391 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0379  hypothetical protein  32.63 
 
 		 340 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  21.67 
 
 		 387 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  20.4 
 
 		 381 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  30.14 
 
 		 407 aa  53.9  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1449  hypothetical protein  21.89 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.831542  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  30.57 
 
 		 417 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1663  hypothetical protein  21.89 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0072  hypothetical protein  26.58 
 
 		 380 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0017  hypothetical protein  26.74 
 
 		 374 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0031  protein of unknown function DUF405  40.45 
 
 		 352 aa  53.9  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  29.43 
 
 		 365 aa  53.1  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  31.39 
 
 		 415 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  21.64 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  19.16 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  37.97 
 
 		 395 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1593  hypothetical protein  21.64 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  30.68 
 
 		 409 aa  51.2  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1818  hypothetical protein  40.28 
 
 		 415 aa  50.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  20.67 
 
 		 387 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  21.45 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  28.88 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  30 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  27.83 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  29.14 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  32.62 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4860  hypothetical protein  35.66 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  32.93 
 
 		 459 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0035  hypothetical protein  26.91 
 
 		 402 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  30.24 
 
 		 393 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4916  protein of unknown function DUF418  27.89 
 
 		 401 aa  47.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511749  normal  0.649012 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4921  hypothetical protein  26.09 
 
 		 265 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0008351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  29.29 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  31.25 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1736  protein of unknown function DUF405  34.38 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.310002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  26.37 
 
 		 388 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  26.17 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  27.62 
 
 		 390 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  37.01 
 
 		 399 aa  45.8  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  19.55 
 
 		 381 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  21.93 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1888  hypothetical protein  28.23 
 
 		 389 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  30.03 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  36 
 
 		 393 aa  43.5  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2567  hypothetical protein  36.99 
 
 		 388 aa  43.5  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  25.84 
 
 		 398 aa  43.1  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2469  hypothetical protein  36.99 
 
 		 388 aa  43.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3015  hypothetical protein  36.99 
 
 		 388 aa  43.1  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00833892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  34.12 
 
 		 385 aa  43.1  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4786  hypothetical protein  37 
 
 		 406 aa  43.1  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>