136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1561 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  774    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2469  hypothetical protein  75.07 
 
 
388 aa  529  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2567  hypothetical protein  75.6 
 
 
388 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3015  hypothetical protein  75.07 
 
 
388 aa  526  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833892 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  64.99 
 
 
385 aa  500  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  63.54 
 
 
395 aa  479  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2383  hypothetical protein  65.08 
 
 
380 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.76362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2427  hypothetical protein  65.08 
 
 
380 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2431  hypothetical protein  64.81 
 
 
380 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.503306  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2338  hypothetical protein  64.81 
 
 
380 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.890901  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  63.61 
 
 
385 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  63.35 
 
 
385 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  63.61 
 
 
385 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  63.61 
 
 
385 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  63.09 
 
 
385 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2286  hypothetical protein  62.83 
 
 
385 aa  456  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1496  hypothetical protein  62.57 
 
 
385 aa  454  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  63.09 
 
 
385 aa  457  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2541  hypothetical protein  65.61 
 
 
380 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0379465  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  59.9 
 
 
391 aa  455  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  60.74 
 
 
391 aa  457  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  61.21 
 
 
382 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  33.67 
 
 
391 aa  171  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  36.11 
 
 
416 aa  166  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  35.43 
 
 
406 aa  162  7e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  32.62 
 
 
416 aa  158  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  35.32 
 
 
398 aa  155  9e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  32.23 
 
 
415 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  35.37 
 
 
414 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  33.99 
 
 
428 aa  152  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  31.71 
 
 
401 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  31.43 
 
 
430 aa  132  6.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  30.95 
 
 
430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  30.53 
 
 
459 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  30.17 
 
 
411 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  29.44 
 
 
399 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  30.25 
 
 
411 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  30.17 
 
 
401 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  31.33 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  30.08 
 
 
411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  32.27 
 
 
409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  34.73 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  28.07 
 
 
431 aa  116  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  30.54 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  28.75 
 
 
399 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  28 
 
 
398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  29.7 
 
 
414 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4786  hypothetical protein  29.7 
 
 
406 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6743  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  29.47 
 
 
414 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  34.18 
 
 
364 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  28.35 
 
 
382 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  29.25 
 
 
404 aa  103  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  29.53 
 
 
414 aa  103  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  27.53 
 
 
381 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  25.13 
 
 
312 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  30.32 
 
 
401 aa  97.1  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  25 
 
 
312 aa  96.3  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  25.39 
 
 
390 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  26.77 
 
 
388 aa  87  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  25.99 
 
 
409 aa  85.9  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  26.03 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1119  protein of unknown function DUF405  28.14 
 
 
381 aa  84  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4860  hypothetical protein  31.49 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138362  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  26.75 
 
 
412 aa  84  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  30.33 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14550  predicted membrane protein  31.11 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127501  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  30.67 
 
 
410 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4916  protein of unknown function DUF418  28.64 
 
 
401 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511749  normal  0.649012 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4889  hypothetical protein  25.94 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  31.37 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  27.65 
 
 
387 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1888  hypothetical protein  28.32 
 
 
389 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24980  predicted membrane protein  24.94 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  34.01 
 
 
204 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  26.72 
 
 
387 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  27.27 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4858  hypothetical protein  26.57 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0691  hypothetical protein  37.9 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4882  hypothetical protein  26.32 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5203  conserved membrane spanning protein  44.17 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  26.58 
 
 
387 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0379  hypothetical protein  26 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  27.32 
 
 
387 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25000  predicted membrane protein  25.87 
 
 
387 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  40.16 
 
 
381 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25010  predicted membrane protein  26.75 
 
 
417 aa  70.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  35.54 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  44.26 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  43.9 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0371  hypothetical protein  27.59 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  27.92 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1675  protein of unknown function DUF405  30.51 
 
 
375 aa  66.2  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.965008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  26.22 
 
 
387 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  34.59 
 
 
387 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1593  hypothetical protein  34.59 
 
 
387 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1449  hypothetical protein  34.59 
 
 
387 aa  62.8  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.831542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1663  hypothetical protein  34.59 
 
 
387 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  27.09 
 
 
388 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  27.18 
 
 
401 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  29.87 
 
 
407 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>