142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2327 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  733    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  33.33 
 
 
414 aa  129  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  35.13 
 
 
365 aa  126  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  33.83 
 
 
415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  34.23 
 
 
417 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  32.08 
 
 
415 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  31.71 
 
 
405 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  32.91 
 
 
388 aa  112  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  34.29 
 
 
364 aa  109  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  29.46 
 
 
430 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  30.05 
 
 
430 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  29.79 
 
 
420 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  32.72 
 
 
414 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  28.35 
 
 
387 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  26.74 
 
 
387 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  28.96 
 
 
388 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  32.13 
 
 
407 aa  99.8  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  32.52 
 
 
406 aa  99.8  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  32.66 
 
 
401 aa  99.4  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  30.42 
 
 
397 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24880  predicted membrane protein  31.8 
 
 
432 aa  97.1  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  33 
 
 
409 aa  96.7  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  26.42 
 
 
387 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  26.8 
 
 
387 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  32.82 
 
 
399 aa  96.3  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  26.36 
 
 
387 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1492  hypothetical protein  26.85 
 
 
387 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512867  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  26.23 
 
 
387 aa  94  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  32.75 
 
 
407 aa  92.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  30.17 
 
 
393 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  27.27 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  24.04 
 
 
381 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  32.17 
 
 
439 aa  90.1  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1449  hypothetical protein  26.55 
 
 
387 aa  89.7  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.831542  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  28.89 
 
 
391 aa  89.7  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1663  hypothetical protein  26.55 
 
 
387 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  26.94 
 
 
412 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  30.57 
 
 
401 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  26.29 
 
 
387 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1593  hypothetical protein  26.29 
 
 
387 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  27.38 
 
 
389 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  29.47 
 
 
416 aa  87.4  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  30.81 
 
 
428 aa  86.7  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  27.76 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  30.87 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  29.82 
 
 
407 aa  84  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  30.58 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  28.83 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  25.07 
 
 
362 aa  84  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  31.23 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  25.48 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  24.38 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  24.3 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  29.1 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220914 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  29.37 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  29.55 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  27.75 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  29.37 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  31.36 
 
 
410 aa  80.5  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  28.17 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  23.84 
 
 
312 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  23.17 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  27.93 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  31.14 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  30.19 
 
 
405 aa  79.3  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4293  protein of unknown function DUF418  28.65 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1198  hypothetical protein  23.26 
 
 
399 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2286  hypothetical protein  29.55 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  29.1 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2431  hypothetical protein  29.92 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.503306  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2338  hypothetical protein  29.92 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.890901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0072  hypothetical protein  32.3 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1199  hypothetical protein  25.06 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  27.46 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1063  protein of unknown function DUF405  31.47 
 
 
472 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2383  hypothetical protein  29.92 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.76362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2427  hypothetical protein  29.92 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  29.6 
 
 
398 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  27.46 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  31.62 
 
 
414 aa  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1496  hypothetical protein  29.55 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  29.1 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  26.32 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  29.1 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  25.68 
 
 
459 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  27.15 
 
 
411 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  22.37 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  26.13 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  26.76 
 
 
431 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  27.72 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2541  hypothetical protein  29.92 
 
 
380 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0379465  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4786  hypothetical protein  29.68 
 
 
406 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6743  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1818  hypothetical protein  28.07 
 
 
415 aa  70.5  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8802  hypothetical protein  28.72 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  27.72 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1304  hypothetical protein  26.15 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5203  conserved membrane spanning protein  28.81 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0035  hypothetical protein  26.52 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  27.61 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  28.57 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>