127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0622 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  855    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3111  protein of unknown function DUF418  61.19 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1063  protein of unknown function DUF405  54.25 
 
 		 472 aa  363  4e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  51.65 
 
 		 420 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  49.26 
 
 		 414 aa  309  8e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  48.91 
 
 		 401 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3607  protein of unknown function DUF418  48.35 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.526186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  44.01 
 
 		 397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  43.88 
 
 		 388 aa  246  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24880  predicted membrane protein  42.47 
 
 		 432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  41.4 
 
 		 407 aa  218  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0072  hypothetical protein  41.65 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  39.61 
 
 		 405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  38.25 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  40 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  37.17 
 
 		 392 aa  199  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  37.47 
 
 		 407 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  36.67 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1236  hypothetical protein  38.46 
 
 		 399 aa  189  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4293  protein of unknown function DUF418  38.95 
 
 		 390 aa  189  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0719  protein of unknown function DUF418  40.66 
 
 		 405 aa  179  8e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1078  protein of unknown function DUF418  37.4 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0035  hypothetical protein  34.19 
 
 		 402 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3780  hypothetical protein  35.61 
 
 		 401 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4159  hypothetical protein  35.16 
 
 		 401 aa  149  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.776458  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0984  protein of unknown function DUF418  38.73 
 
 		 387 aa  126  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0392587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  30.5 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  33.83 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  26.71 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  28.43 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  26.15 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  25.8 
 
 		 390 aa  88.2  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  29.78 
 
 		 392 aa  87.8  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  26.92 
 
 		 414 aa  87.4  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  26.7 
 
 		 387 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  22.89 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  25.55 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  29.2 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  21.58 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  25.71 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  30.24 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  28.75 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  25.89 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  22.75 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  28.09 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  25.8 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  29.41 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  31.47 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  21.9 
 
 		 381 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1449  hypothetical protein  27.74 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.831542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1663  hypothetical protein  27.74 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  27.65 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1593  hypothetical protein  27.65 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  23.99 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  25.93 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  27.48 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  25.79 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  27.27 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  25.47 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  23.37 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  27.4 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  27.01 
 
 		 387 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  27.27 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  26.46 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  24.57 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  24.04 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  30.67 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4916  protein of unknown function DUF418  26.46 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511749  normal  0.649012 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  26.93 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  27.4 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  25.06 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  23.3 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1198  hypothetical protein  21.67 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  24.24 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  35.58 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  24.13 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1492  hypothetical protein  26.7 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512867  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  25.81 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1818  hypothetical protein  25.56 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  23.83 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  23.83 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1199  hypothetical protein  23.73 
 
 		 398 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  26.36 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  35.06 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  35.06 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  32.42 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  23.75 
 
 		 414 aa  57  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4921  hypothetical protein  21.9 
 
 		 265 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0008351  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  23.24 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  27.98 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1496  hypothetical protein  32.69 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  27.32 
 
 		 364 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  31.73 
 
 		 385 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  31.73 
 
 		 385 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  31.73 
 
 		 385 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2286  hypothetical protein  31.73 
 
 		 385 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  24.01 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  31.73 
 
 		 385 aa  53.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1888  hypothetical protein  26.69 
 
 		 389 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25010  predicted membrane protein  25.55 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>