144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2882 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  82.64 
 
 
399 aa  650    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  97.34 
 
 
414 aa  793    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  836    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  95.17 
 
 
414 aa  773    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  76.53 
 
 
411 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  76.53 
 
 
411 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  75.51 
 
 
401 aa  607  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  76.35 
 
 
411 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  72.32 
 
 
398 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  55.03 
 
 
399 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  55.73 
 
 
382 aa  402  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0691  hypothetical protein  44.85 
 
 
381 aa  298  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  28.54 
 
 
406 aa  130  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  29.79 
 
 
416 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  30.32 
 
 
364 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  30.37 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  28.33 
 
 
395 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  26.78 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  27.2 
 
 
381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  29.7 
 
 
393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  28.21 
 
 
391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  28.61 
 
 
414 aa  113  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  28.78 
 
 
416 aa  113  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  32.21 
 
 
365 aa  113  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  29.21 
 
 
428 aa  113  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  27.71 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  28.17 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  27.99 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  27.72 
 
 
385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  27.89 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  30.32 
 
 
382 aa  111  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  28.72 
 
 
385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2286  hypothetical protein  27.74 
 
 
385 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  28.28 
 
 
385 aa  110  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1496  hypothetical protein  27.74 
 
 
385 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  30.27 
 
 
409 aa  109  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  27.95 
 
 
417 aa  109  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  27.75 
 
 
401 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  27.64 
 
 
391 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  27.16 
 
 
381 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4860  hypothetical protein  28.8 
 
 
387 aa  106  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138362  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  25.88 
 
 
398 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  27.55 
 
 
381 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  28.17 
 
 
381 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  27.63 
 
 
387 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  28.46 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2431  hypothetical protein  26.74 
 
 
380 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.503306  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2338  hypothetical protein  26.48 
 
 
380 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.890901  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  27.09 
 
 
404 aa  96.7  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  29.24 
 
 
387 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  28.27 
 
 
387 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2383  hypothetical protein  26.48 
 
 
380 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.76362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2427  hypothetical protein  26.48 
 
 
380 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  28.8 
 
 
312 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  27.59 
 
 
430 aa  93.2  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2541  hypothetical protein  26.38 
 
 
380 aa  92.8  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0379465  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  27.59 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3015  hypothetical protein  30.39 
 
 
388 aa  92.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833892 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1492  hypothetical protein  28.61 
 
 
387 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  25.13 
 
 
390 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  27.09 
 
 
430 aa  92  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  26.37 
 
 
415 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2567  hypothetical protein  30.83 
 
 
388 aa  90.9  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  29 
 
 
409 aa  90.9  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  25.45 
 
 
389 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  33.79 
 
 
204 aa  90.5  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2469  hypothetical protein  30.57 
 
 
388 aa  89.7  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1449  hypothetical protein  26.82 
 
 
387 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.831542  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4786  hypothetical protein  27.57 
 
 
406 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6743  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1663  hypothetical protein  26.82 
 
 
387 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  27.96 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  26.63 
 
 
387 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1593  hypothetical protein  26.63 
 
 
387 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4858  hypothetical protein  28.23 
 
 
340 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1888  hypothetical protein  27.14 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  26.34 
 
 
459 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4889  hypothetical protein  27.2 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1199  hypothetical protein  24.49 
 
 
398 aa  82.8  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0371  hypothetical protein  29.21 
 
 
397 aa  82.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0379  hypothetical protein  27.32 
 
 
340 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  23.99 
 
 
414 aa  82.4  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  26.2 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  24.32 
 
 
407 aa  82  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  24.4 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5203  conserved membrane spanning protein  26.33 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4882  hypothetical protein  27.3 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  26.23 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  27.86 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4644  hypothetical protein  37.42 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4998  hypothetical protein  37.42 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  28.08 
 
 
404 aa  77  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4479  membrane spanning protein  37.89 
 
 
340 aa  77  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.43 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.037271 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4497  membrane spanning protein  39.58 
 
 
340 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  23.37 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4868  hypothetical protein  37.27 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25010  predicted membrane protein  26.77 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1198  hypothetical protein  20.47 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1304  hypothetical protein  26.63 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  27.3 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220914 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>