136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15990 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  100 
 
 		 414 aa  780    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  49.26 
 
 		 439 aa  310  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  48.73 
 
 		 420 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3607  protein of unknown function DUF418  48.03 
 
 		 407 aa  280  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.526186  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1063  protein of unknown function DUF405  44.71 
 
 		 472 aa  250  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3111  protein of unknown function DUF418  48.49 
 
 		 443 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  42.45 
 
 		 401 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24880  predicted membrane protein  44.14 
 
 		 432 aa  230  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  41.73 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  43.07 
 
 		 407 aa  197  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  40.85 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  42.54 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  36.88 
 
 		 393 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  41.49 
 
 		 399 aa  176  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0072  hypothetical protein  40.46 
 
 		 380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  38.14 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1078  protein of unknown function DUF418  42.41 
 
 		 384 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  37.15 
 
 		 398 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  37.56 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4293  protein of unknown function DUF418  40.83 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0719  protein of unknown function DUF418  41.83 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1236  hypothetical protein  38.02 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0035  hypothetical protein  35.86 
 
 		 402 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3780  hypothetical protein  34.34 
 
 		 401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  29.23 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4159  hypothetical protein  34.52 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.776458  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  33.66 
 
 		 407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0984  protein of unknown function DUF418  33.65 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0392587  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  26.46 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  29.2 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  28.96 
 
 		 430 aa  95.5  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  25.31 
 
 		 411 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  25.06 
 
 		 411 aa  92.8  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  24.94 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  24.94 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  25.06 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  28.34 
 
 		 430 aa  90.1  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  24.88 
 
 		 412 aa  90.1  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  28.64 
 
 		 397 aa  89.7  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  24.44 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  28.99 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  24.76 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  29.7 
 
 		 391 aa  86.3  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  24.57 
 
 		 399 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  23.28 
 
 		 398 aa  82  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  29.19 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  29.63 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  23.54 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  27.16 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  23.36 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1119  protein of unknown function DUF405  30.46 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  28.78 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  27.66 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  26.5 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  30 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  29.19 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  26.9 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  28.72 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  30.03 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  26.08 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  32.03 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  27.45 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  22.44 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4916  protein of unknown function DUF418  28.46 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511749  normal  0.649012 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  30.86 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  28.66 
 
 		 381 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  30.91 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  21.79 
 
 		 381 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  27.18 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  22.38 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  24.37 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  20.78 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1199  hypothetical protein  21.74 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  28.24 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  24 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  30.36 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  28.11 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  30.1 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  32.09 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  27.17 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  35.04 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  29.05 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  22.62 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  28.11 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  27.01 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  28.01 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1675  protein of unknown function DUF405  29.68 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.965008  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  33.08 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1171  protein of unknown function DUF418  26.45 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  28.11 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  28.11 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  28.11 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1818  hypothetical protein  25.84 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5203  conserved membrane spanning protein  29.92 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4479  membrane spanning protein  27.1 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1198  hypothetical protein  21.26 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4882  hypothetical protein  27.1 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4889  hypothetical protein  27.1 
 
 		 340 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  30.29 
 
 		 409 aa  54.3  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0379  hypothetical protein  27.1 
 
 		 340 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>